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宏基因组(Metagenomics)又称为元基因组,由Handelsman等人在1998年首次提出这一概念,指特定生境中全部微小生物遗传物质的总和,包含了可培养的和不可培养的微生物基因。目前主要以生境中全部细菌和真菌基因组DNA为研究对象,研究其功能和彼此之间的关系和相互作用,从而揭示其内在机制。

 

随着分子生物学技术在微生物生态学研究中的广泛应用,促进了以强调微生物群落基因组为整体研究对象,研究特定生境中微生物群落结构、功能代谢、进化关系以及对环境因子的响应为主的微生物环境基因组学或称为宏基因组学技术。

 

以高通量测序为基础的宏基因组研究方法则可以直接对环境样品中分离的遗传物质进行深度测序,已经被证实在探索微生物生态生理特性、复杂环境微生物群落的代谢方式以及从核苷酸构建的文库中鉴定新型生物分子等方面有着不可替代的作用。


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