• 技术简介
  • 研究方案

1997年Velculescu等首次将特定细胞在特定时间段表达的所有基因总和称为转录组。转录组学研究中方法学的改进包括使用流式细胞仪筛选活性细胞(fluorescently activated cell sorting, FACS)并重测序基因组序列、使用稳定同位素标签(stable-isotope probing, SIP)追踪群落中代谢活跃的成员、使用溴脱氧尿苷(BrdU)标记的胸腺嘧啶核苷类似物标记生长中的细胞用于分离测序或者直接分离纯化RNA并测序,从而了解何种微生物活跃以及何种基因被表达,当上述方法运用到微生物群落中时,这些技术被总称为宏转录组技术(Metatranscriptomics)。

 

相对于基因组或宏基因组主要应对单个微生物或微生物群落的基因代谢潜力,转录组与宏转录组就更加直接的研究特定因素影响下的单个菌或微生物群落整体基因的表达情况,是针对特定生态位中微生物生存关键基因捕获的有效工具。


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