• 技术简介
  • 研究方案

mate pair文库,即为通常所说的大片段文库,其数据可很好地延长Scaffold N50的长度,在一定程度上减少scaffold的数量,从而显著提高组装结果,并有利于后续生物学意义的深入和准确挖掘,以达到国际上影响因子较高杂志的文章要求。

 

由于大片段文库构建流程的特殊性及其对实验经验的高要求,其构建难度远高于shotgun文库。大片段文库的构建难度主要体现在以下几个方面:

          随着插入片段越长文库构建成功率越低;

          不同物种基因组的重复度高低等指标均会影响大片段文库插入片段长度的目标值;

          随着插入片段的增大,文库冗余率的升高等均会影响大片段文库最终有效数据的产出。


mate pair文库,即为通常所说的大片段文库,其数据可很好地延长Scaffold N50的长度,在一定程度上减少scaffold的数量,从而显著提高组装结果,并有利于后续生物学意义的深入和准确挖掘,以达到国际上影响因子较高杂志的文章要求。
 
由于大片段文库构建流程的特殊性及其对实验经验的高要求,其构建难度远高于shotgun文库。大片段文库的构建难度主要体现在以下几个方面:
          随着插入片段越长文库构建成功率越低;
          不同物种基因组的重复度高低等指标均会影响大片段文库插入片段长度的目标值;
          随着插入片段的增大,文库冗余率的升高等均会影响大片段文库最终有效数据的产出。
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