Ion PGM

1. 平台简介      

        Life Technologies于2010年底推出了首款半导体测序仪Ion Personal Genome Machine(PGM )测序仪。PGMTM台式系统的设计配合革新性的半导体芯片技术,使整个平台具有极高的扩展性和快速完成测序的性能。Ion Torrent技术通过专有的大规模并行半导体感应器,对于DNA扩增时产生的离子流,实现直接和实时的检测。当试剂通过集成的流体通路进入Ion Torrent半导体芯片中,密布于芯片上的反应孔立即成为上百万个微反应体系。这种独特的流体体系,微体系机械设计和半导体的技术组合,使我们得以快速直接的将遗传信息翻译成数码的DNA测序结果,得到大量高质量的测序数据。  


2. 应用领域       

          可应用于微生物基因组测序和重测序,靶标(扩增子)区域重测序。 


3. 技术特点         

          强大的扩展性:大规模可扩展的半导体芯片技术。         
          简捷易用的技术:自然的生物化学原理,无需光学部件。
         
          无以伦比的快速:2个小时完成测序工作。
 


4. 数据产出        

          测序读长35-400bp,单次运行的最短时间为90min,单次运行的测序通量为10M-1G。其中Ion 314TM芯片包括100万个反应孔,通量为10M;Ion 316TM芯片包括600万个反应孔,通量为100M;Ion 318TM芯片包括1100万个反应孔,通量为1G。 


5. 实验流程        

          Ion Torrent的标准测序流程包括准备随机片段的DNA文库或者扩增子文库、样本的 PCR扩增及在PGMTM的测序运行。完成整个PGMTM的测序运行后,数据将会自动导入专用的Torrent预装分析套件的计算机服务器。在这里,原始的测序信号会转化成碱基序列并且以标准的 SFF 或者 FASTAQ 格式存储起来。这些测序数据可以通过众多商业化的软件进行后续不同应用的分析或者全新基因组的拼接。 


2017年01月04日

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