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DNA甲基化是表观遗传修饰的重要组成部分,在多种生物学过程中发挥重要作用,包括正常细胞功能的行使,遗传印迹、肿瘤发生等。对DNA甲基化的深入研究是更好地理解人类遗传发育和疾病发生所不可或缺的,是目前相关领域的研究热点。Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片能够更经济高效地开展DNA甲基化相关的分析和研究。

 

1. 空前的全基因组覆盖

Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片包含高达485,512条探针,覆盖99%RefSeq基因。其中19,755条针对CpG岛的探针(涵盖96%的CpG岛),3091条针对CpG岛以外的CpG位点。除了CpG位点,这些探针还涵盖了人干细胞中已鉴定的非CpG的甲基化位点、不同组织的甲基化差异位点、正常组织与多种肿瘤(癌症)甲基化差异位点。不仅如此,Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片所包含的探针还覆盖了目前FANTOM4数据库中已收录的启动子区域、DNA酶敏感区域和microRNA的启动子区域。作为Illumina HumanMethylation27 BeadChip芯片的更新产品,Infinium HumanMethylation450 BeadChip涵盖了Illumina HumanMethylation27 BeadChip芯片90%以上的区域。

 

2. 高质量的数据

Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片在采用Infinium I探针设计的同时,也整合了Infinium II探针设计。其中Infinium I探针设计两根探针检测一个位点,InfiniumⅡ探针只使用一根探针。Infinium I的准确性和Infinium II的更广覆盖度,相互补充相互验证,加上我公司出色的技术团队,保证可以让研究者获得行业领先的数据质量。

 

3. 基因整合分析

Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片涵盖99%RefSeq基因,涵盖microRNA的启动子区域,为全基因组水平上的甲基化研究与其他高通量研究方法(基因表达谱研究等)相结合的综合分析奠定基础。

 

4. 灵敏度、精确度和重复性

通过的八个生物学重复的样本进行检测,结果显示Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片可靠检测0.2的delta-beta值,且假阳性率低于1%。技术性重复结果显示,Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片的相关性达到99.69%。而且Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片与HumanMethylation27 BeadChip芯片检测结果的相关性达到97.07%,与全基因组重亚硫酸盐测序结果的相关性达到92%。

 

5. FFPE样本适用

Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片适用于FFPE样本。


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