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DNA甲基化是表观遗传修饰的重要组成部分,在多种生物学过程中发挥重要作用,包括正常细胞功能的行使,遗传印迹、肿瘤发生等。对DNA甲基化的深入研究是更好地理解人类遗传发育和疾病发生所不可或缺的,是目前相关领域的研究热点。Illumina 850K Infinium MethylationEPIC BeadChip芯片Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片的全新升级版,能够更经济高效地开展DNA甲基化相关的分析和研究。

 

1. 空前的全基因组覆盖

Illumina 850K Infinium MethylationEPIC BeadChip芯片可以基于单核苷酸分辨率定量检测基因组中的850,000多个甲基化位点,覆盖位点包括:CpG岛外的CpG位点;在人类干细胞中识别的非CpG甲基化位点(CHH位点);在肿瘤中与在正常细胞中识别的差异甲基化位点;FANTOM5增强子;ENCODE开放染色质和增强子;DNase超敏感位点;miRNA启动子区域;同时覆盖了Illumina HumanMethylation450K BeadChip中包含的90%以上的内容。作为Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片的更新产品,Illumina 850K Infinium MethylationEPIC BeadChip涵盖了Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片90%以上的区域。

 

2. 高质量的数据

Illumina 850K Infinium MethylationEPIC BeadChip芯片也延用了Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片的Infinium I探针设计的同时,也整合了Infinium II探针设计。其中Infinium I探针设计两根探针检测一个位点,Infinium探针只使用一根探针。Infinium I的准确性和Infinium II的更广覆盖度,相互补充相互验证,加上我公司出色的技术团队,保证可以让研究者获得行业领先的数据质量。

 

3. 基因整合分析

Illumina 850K Infinium MethylationEPIC BeadChip芯片涵盖99%RefSeq基因,涵盖microRNA的启动子区域,为全基因组水平上的甲基化研究与其他高通量研究方法(基因表达谱研究等)相结合的综合分析奠定基础。

 

4. 灵敏度、精确度和重复性

通过的八个生物学重复的样本进行检测,结果显示Illumina 850K Infinium MethylationEPIC BeadChip芯片可靠检测0.2delta-beta值,且假阳性率低于1%。技术性重复结果显示,Illumina 850K Infinium MethylationEPIC BeadChip芯片的相关性达到99.69%

 

5. FFPE样本适用

Illumina 850K Infinium MethylationEPIC BeadChip芯片适用于FFPE样本。

 


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