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细菌转录组学是指利用高通量测序技术从细菌RNA水平研究基因表达的情况。通过对细菌特定时期或特定生理条件下的转录本进行测序,可以获得特定情况下全基因组范围内基因的转录情况,比起基因组数据更加动态,为了解基因调节和蛋白信息提供了更加直接的途径,从而揭示细菌适应不同环境的内部响应。高通量转录组测序技术可以对转录本进行高分辨率的深度测序,相对于传统的芯片杂交技术,无需预先设计探针,无需依靠基因组图谱指导拼接等优势,可以对任意来源的RNA样本进行检测,并直接完成基因的注释及量化,现在越来越多的被用在生物学、流行病学、临床医学等研究领域。

 

Illumina公司的HiSeq平台目前在细菌转录组学的研究中应用最广,其中HiSeq2500高通量模式一个run最高可以产生180Gb的数据量,同时满足数百个细菌转录组样品的上机测序。由于原核生物mRNA没有polyA尾巴,不能通过oligo(dT)进行捕获,只能利用去除rRNA的方法来进行纯化,千年基因提供的细菌转录组测序服务,保证使用Ribo-zero rRNA Removal Kit(Bacteria)试剂盒两次去除rRNA,最终获得高质量高纯度的mRNA。


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