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当所研究的物种没有参考基因组序列及功能基因注释信息或者参考基因组序列信息不完整,为能够获得该物种在特定时期、特定实验条件下所表达的功能基因信息,就可以通过转录组de novo测序来实现。


转录组de novo测序有以下研究意义:

(1)首先是在不能成功获得基因组参考序列信息的情况下,可尽可能全面地获得某物种全部的转录本和功能基因信息;其次就是可以获得一方面主要是可以获得其不同时空表达的转录本和功能跟基因信息,然后可以针对不同时空表达的基因信息做比较分析,从而获得某些特定性状对应的功能基因信息及代谢通路信息等。

(2)其次是在全基因组de novo测序中,加入不同时空样本或不同亚群、个体的转录组测序数据,可进一步验证基因组的组装结果,并且能够在基因组组装完成后的基因预测中起到辅助注释作用,从而能够对基因组组装结果以及注释结果起到双重的验证作用。


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