质量认证:

千年基因是国内唯一一家通过Pacific Biosciences CSP (Certified Service Provider)认证的公司,在Pacific Biosciences的监督下,向研究人员提供最高质量的三代测序。

 

CSP认证信息见如下链接:http://www.pacb.com/products-and-services/service-providers/



 

质量标准:

严格的质量控制,各项数据指标已达国内最高水平。碱基准确度>99.999%(QV50),读长最长可达50Kb,reads N50高达25Kb,数据产出高达1.4Gb/SMRT Cell,远超PacBio官方提供的数据标准。

 

结果展示:

如下为千年基因应用PacBio RS II完成的某高杂合昆虫基因组de novo测序结果,可见原始数据和subreads数据产出均可稳定在1Gb/Cell以上,subreads平均长度可稳定在8Kb左右,有利于基因组拼接获得更长的Contigs。

 

表1. 原始数据产出

Cell Name

Filter

Polymerase Read Bases

Polymerase Reads

Polymerase Read N50

Polymerase Read Length

Polymerase Read Quality

1

Pre-Filter

1,258,042,933

150,292

15,927

8,370

0.586

Post-Filter

1,218,199,242

102,777

16,031

11,852

0.831

2

Pre-Filter

1,291,844,918

150,292

16,389

8,595

0.592

Post-Filter

1,242,215,613

103,136

16,507

12,044

0.833

3

Pre-Filter

1,338,509,455

150,292

16,252

8,906

0.615

Post-Filter

1,284,244,611

107,042

16,374

11,997

0.834

4

Pre-Filter

1,246,603,366

150,292

16,179

8,294

0.569

Post-Filter

1,212,426,685

99,908

16,289

12,135

0.829


表2. sbureads数据产出

Cell Name

Subread Bases

Subreads

Avg. Subread length

1

1,216,208,739

142,387

8,541

2

1,240,251,777

141,712

8,751

3

1,282,216,678

146,746

8,737

4

1,210,465,949

138,614

8,732


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